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· Biojava 及其在生物序列分析中的应用
     摘要:Biojava 是近来出现的一个免费的,且代码开放的java工具包。它包含有许多有关序列分析的工具,如序列操作,文件解析,CORBA交互,DAS(Distributed Annotation System, 分布式注释系统),对多种数据库(ACEDB, ensembl等)的访问接口,以及多个序列分析工具,如HMM(Hidden Markov Models, 隐马尔科夫模型),动态规划等。本文介绍了该工具包的特色、基本概念、组成以及用途,并且,通过Biojava和普通java解决一个小的HMM实例,比较和说明Biojava在生物序列分析上的优越性和应用前景。 关键词:Biojava 生物序列分析 HMM(隐马尔科夫模型)
· 结核分枝杆菌的细胞壁成分的免疫性
     摘要 我们将结核分枝杆菌H37Rv培养在苏通氏培养基,利用脱氧胆酸钠化学裂解剂有效裂解了活的有毒力的结核分枝杆菌,通过葡聚糖G-200分子筛柱获得三个峰D1,D2,D3,制备了三种胞浆蛋白成分。这三种成分用于ELISA试验,对结核分枝杆菌兔高免血清,结果显示D1,D2成分具有抗原性;D3成分无抗原性。并与几种PPD抗原成分进行比较,D2成分特异性较好,P/N值最大,与其它血清的交叉反应最弱,我们将D2用于对自然感染的猴血清进行检测,也显示较好的抗原性。因此,分离的胞浆蛋白成分D2可以作为猴结核病血清抗体检测的抗原制剂。
· 用Monte Carlo模拟产生概率模型随机数据
     摘要:Monte Carlo 模拟是一种复杂的数学技术,用来估计未来情况。该技术在许多领域都得到了应用,如金融投资、航空航天、物理、地质和生物等诸多领域。模拟离不开随机数,本报告简单介绍随机数产生的一些常用方法,并用Monte Carlo 模拟法产生几个常用概率分布的的随机数据,包括连续概率分布(正态分布)和离散概率分布(二项分布和泊松分布)。 关键词:随机数 Monte Carlo 模拟 概率模型
· 《生物信息学网络资源与应用》一书简介
     从达尔文进化论开始,孟德尔遗传定律的发现、分子生物学中心法则的建立直至人类基因组计划图谱的公布,人类在认识生命的进程中步步为营,现正面临破译、解读、调节和开发利用基因组功能的新阶段。一方面,生物技术的快速进步,似乎使我们操纵生命有随心所欲的快感,另一方面,生物信息的扑朔迷离依然使我们洞察生命仍雾里看花般茫然。
· 实验动物和公园动物中SARS病原来源调查初报
     摘 要 目的:调查SARS冠状病毒的动物来源。方法:用冠状病毒通用引物的反转录巢式PCR方法对采集的动物呼吸道分泌物或咽拭子标本进行检测,用血清学方法(EIASA)对动物血清进行检测,确定阳性的初筛动物。结果:分别从各实验动物猴、犬饲养场、广州动物园共采集拭子标本84份,包括的动物品种有猴、犬、小灵猫、果子狸、狒狒、巨蜥、滑鼠蛇、巴西龟、孔雀、鸭子、鸽子等,PCR方法检测,未检出SARS冠状病毒;另抽取16个单位373只小鼠和9个单位198只大鼠的血清,用ELISA方法检查,有52只鼠检出鼠冠状病毒抗体。实验动物SARS冠状病毒的追溯研究是从根本上防治SARS病的重要环节之一。
· 实验动物屏障设施常用装修材料的特性比较
     摘要:对实验动物屏障设施常用的装修材料的各种性能进行综合比较,比较结果表明,实验动物屏障设施地板材料以环氧树酯为较好的选择,墙面和天花材料以耐火型彩钢夹板、不锈钢板等材料较优秀。该结果可为制药厂房、电子厂房等建设选材参考。 关键词:实验动物设施 洁净室 材料性能
· 病毒感染触发细胞信号转导引起细胞因子的产生
     细胞因子是在天然免疫和特异性免疫的激活和效应阶段产生的并能介导和调节免疫和炎症应答作用的功能性蛋白质,其数量和类型众多,如白介素类(IL-1、IL-2、IL-6、IL-10),干扰素(INF)、肿瘤坏死因子(TNF)等。病毒侵入机体后,可触发宿主免疫系统产生强烈的免疫反应,对一系列病毒来说,仅仅病毒表面蛋白与细胞表面蛋白的相互作用就可启动细胞反应,引起感染后的第一次细胞因子的产生。
· 转基因动物模型和SAM小鼠在AD研究中的应用
     老年性痴呆(AD)作为一种严重危害人类生存质量的疾病受到了众多学者的关注。目前,由于老年性痴呆的确切病因不清楚,病理机制非常复杂,更缺乏有效的治疗措施,因此,研究并建立可靠的老年性痴呆动物模型对于探明老年性痴呆的病因、发病机制及防治药物的研究与开发均具有重要的意义。
· 非人灵长类Aβ脑内注射造老年痴呆模型的质量控制
     对于AD的研究以及治疗来说,模型的建立成功与否起到很大的作用。在AD动物模型建造方法中,从病理学、病因学及经济学角度综合考虑,Aβ脑内注射相比自然衰老、药物注射等是较合适的。
 
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